93년 8월 금융실명제가 실시되면서 증권가를 중심으로 대통령의 비자금 보유설이 나돌고 1995년 10월 19일 민주당 박계동 의원이 국회 대정부 질의에서 신한은행 서소문 지점에 (주)우일양행 명의로 예치된 110억 원의 예금계좌 조회표를 제시하며 노태우의 비자금 4,000억 원이 여러 시중 은행에 차명계좌로 분산 예치되어 있다는 의혹을 제기하면서부터 구체적인 수사가 시작되어 이 자금이 노태우의 비자금임이 밝혀졌다.
시민들은 극도로 분노하여 노태우 전 대통령의 엄중한 처벌을 요구하는 피켓을 들고 연일 시위에 돌입하였고, 노태우 전 대통령 구속수사 및 비자금 환수 촉구를 요구하는 서명운동을 벌이기도 하였다.
민주노총 준비위가 명동성당 앞에서 노태우 구속 및 5.18특별법 제정을 촉구하는 시위를 가지기도 하였다. 검찰의 수사가 활기를 띠자 노태우는 대국민 성명을 발표, 재임 중 기업체로부터 5,000억 원 가량을 받아 사용하고 1700억원 가량이 남았다고 밝혔으나, 수사과정에서는 당초 주장과는 달리 기업체로부터 3,400∼3,500억원을 받고, 1987년 대통령 선거를 위해 조성한 자금 중 사용하고 남은 돈과 당선 축하금 1,100억 원을 합해 조성했다고 진술했다. 최초로 전직 대통령에게 실형이 내려졌으나 국민의 관심을 끌었던 1992년 대선 자금 지원에 관한 부분은 끝까지 진술을 거부하여 밝혀지지 않았고,노태우는 국민의 정부 출범을 맞아 사면, 복권되었다.